Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL24A1Q17RW2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL24A1Q17RW2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
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