Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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PTPRNQ16849 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRNQ16849 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRNQ16849 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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PTPRNQ16849 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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PTPRNQ16849 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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PTPRNQ16849 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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PTPRNQ16849 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRNQ16849 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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