Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP35Q16560 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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