Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNAPC1Q16533 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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