Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNXAQ16473 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms