Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NTRK3Q16288 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NTRK3Q16288 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
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