Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC85BQ15834 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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