Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP4Q15650 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP4Q15650 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP4Q15650 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP4Q15650 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP4Q15650 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIP4Q15650 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIP4Q15650 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP4Q15650 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP4Q15650 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP4Q15650 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP4Q15650 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP4Q15650 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP4Q15650 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP4Q15650 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP4Q15650 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIP4Q15650 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIP4Q15650 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIP4Q15650 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIP4Q15650 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP4Q15650 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP4Q15650 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP4Q15650 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP4Q15650 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP4Q15650 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIP4Q15650 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIP4Q15650 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.27■■□□□ 1
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