Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CNN3Q15417 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNN3Q15417 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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