Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PDCD1Q15116 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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