Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPNMBQ14956 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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