Protein–RNA interactions for Protein: Q14677

CLINT1, Clathrin interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLINT1Q14677 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLINT1Q14677 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.3 ms