Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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SEMA3AQ14563 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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SEMA3AQ14563 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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SEMA3AQ14563 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEMA3AQ14563 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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SEMA3AQ14563 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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