Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE4AQ14139 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
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