Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPTAN1Q13813 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms