Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MTMR3Q13615 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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