Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC1Q13547 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
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