Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LSAMPQ13449 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LSAMPQ13449 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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