Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKRN4PQ13434 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
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MKRN4PQ13434 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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MKRN4PQ13434 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN4PQ13434 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
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