Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
XRCC4Q13426 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
XRCC4Q13426 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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