Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGCGQ13326 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SGCGQ13326 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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