Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHAF1BQ13112 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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