Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM32Q13049 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM32Q13049 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM32Q13049 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM32Q13049 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM32Q13049 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM32Q13049 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM32Q13049 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM32Q13049 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM32Q13049 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM32Q13049 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM32Q13049 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM32Q13049 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM32Q13049 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM32Q13049 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM32Q13049 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM32Q13049 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM32Q13049 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM32Q13049 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM32Q13049 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms