Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STRN3Q13033 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STRN3Q13033 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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