Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFEMP1Q12805 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFEMP1Q12805 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms