Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 DAD3YBR233W-A 285 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 TRS20YBR254C 528 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 YPL216WYPL216W 3309 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 YBT1YLL048C 4986 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 SEC26YDR238C 2922 nt2.62□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 SAK1YER129W 3429 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 FAR11YNL127W 2862 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 CSF1YLR087C 8877 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 AHC2YCR082W 387 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 ADK1YDR226W 669 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 GPI19YDR437W 423 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 RPS17BYDR447C 411 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 CIC1YHR052W 1131 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 AFB1YLR040C 675 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 LSM2YBL026W 288 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 YNL046WYNL046W 519 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 BI4Q0120 1917 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 VPS41YDR080W 2979 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 SSF2YDR312W 1362 nt2.61□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 SPR3YGR059W 1539 nt2.6□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 IKI3YLR384C 4050 nt2.6□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.6□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 RPS29AYLR388W 171 nt2.6□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 FPR1YNL135C 345 nt2.6□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 snR43snR43 209 nt2.6□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 YEF3YLR249W 3135 nt2.6□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 YKU80YMR106C 1890 nt2.6□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 GPI17YDR434W 1605 nt2.6□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 MET32YDR253C 576 nt2.59□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 SPO13YHR014W 876 nt2.59□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.59□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.59□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.59□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.59□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.59□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.59□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 PHO80YOL001W 882 nt2.59□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 NSL1YPL233W 651 nt2.59□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 YBR209WYBR209W 318 nt2.59□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 YIL166CYIL166C 1629 nt2.59□□□□□ -1.99
SEC39Q12745 PHR1YOR386W 1698 nt2.59□□□□□ -2
SEC39Q12745 KRE33YNL132W 3171 nt2.58□□□□□ -2
SEC39Q12745 snR76snR76 109 nt2.58□□□□□ -2
SEC39Q12745 MTC7YEL033W 420 nt2.58□□□□□ -2
SEC39Q12745 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.58□□□□□ -2
SEC39Q12745 PEX4YGR133W 552 nt2.58□□□□□ -2
SEC39Q12745 YGR290WYGR290W 444 nt2.58□□□□□ -2
SEC39Q12745 EAF6YJR082C 342 nt2.58□□□□□ -2
SEC39Q12745 ARV1YLR242C 966 nt2.58□□□□□ -2
SEC39Q12745 RGM1YMR182C 636 nt2.58□□□□□ -2
SEC39Q12745 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt2.58□□□□□ -2
SEC39Q12745 ALG14YBR070C 714 nt2.58□□□□□ -2
SEC39Q12745 RGA2YDR379W 3030 nt2.58□□□□□ -2
SEC39Q12745 TPS2YDR074W 2691 nt2.58□□□□□ -2
SEC39Q12745 SDC25YLL016W 3147 nt2.58□□□□□ -2
SEC39Q12745 SNU56YDR240C 1479 nt2.58□□□□□ -2
SEC39Q12745 YNL034WYNL034W 1839 nt2.57□□□□□ -2
SEC39Q12745 ORC2YBR060C 1863 nt2.57□□□□□ -2
SEC39Q12745 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.57□□□□□ -2
SEC39Q12745 HNT1YDL125C 477 nt2.57□□□□□ -2
SEC39Q12745 YDR199WYDR199W 366 nt2.57□□□□□ -2
SEC39Q12745 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.57□□□□□ -2
SEC39Q12745 YER189WYER189W 369 nt2.57□□□□□ -2
SEC39Q12745 RAD6YGL058W 519 nt2.57□□□□□ -2
SEC39Q12745 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.57□□□□□ -2
SEC39Q12745 ISU1YPL135W 498 nt2.57□□□□□ -2
SEC39Q12745 PHO2YDL106C 1680 nt2.57□□□□□ -2
SEC39Q12745 RPL27BYDR471W 411 nt2.56□□□□□ -2
SEC39Q12745 GLC7YER133W 939 nt2.56□□□□□ -2
SEC39Q12745 RPL29YFR032C-A 180 nt2.56□□□□□ -2
SEC39Q12745 MPO1YGL010W 525 nt2.56□□□□□ -2
SEC39Q12745 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.56□□□□□ -2
SEC39Q12745 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.56□□□□□ -2
SEC39Q12745 VPS51YKR020W 495 nt2.56□□□□□ -2
SEC39Q12745 YHC1YLR298C 696 nt2.56□□□□□ -2
SEC39Q12745 YOL134CYOL134C 390 nt2.56□□□□□ -2
SEC39Q12745 PSK2YOL045W 3306 nt2.56□□□□□ -2
SEC39Q12745 RPO41YFL036W 4056 nt2.55□□□□□ -2
SEC39Q12745 TSA2YDR453C 591 nt2.55□□□□□ -2
SEC39Q12745 AMS1YGL156W 3252 nt2.55□□□□□ -2
SEC39Q12745 YJL181WYJL181W 1836 nt2.55□□□□□ -2
SEC39Q12745 YLR456WYLR456W 615 nt2.55□□□□□ -2
SEC39Q12745 VMA9YCL005W-A 222 nt2.55□□□□□ -2
SEC39Q12745 TOF1YNL273W 3717 nt2.54□□□□□ -2
SEC39Q12745 YKL044WYKL044W 321 nt2.54□□□□□ -2
SEC39Q12745 VPS20YMR077C 666 nt2.54□□□□□ -2
SEC39Q12745 RPL36AYMR194W 303 nt2.54□□□□□ -2
SEC39Q12745 ECM5YMR176W 4236 nt2.53□□□□□ -2
SEC39Q12745 SWR1YDR334W 4545 nt2.53□□□□□ -2
SEC39Q12745 YGR050CYGR050C 357 nt2.53□□□□□ -2
SEC39Q12745 SVS1YPL163C 783 nt2.53□□□□□ -2
SEC39Q12745 TRM7YBR061C 933 nt2.53□□□□□ -2
SEC39Q12745 IRC8YJL051W 2469 nt2.53□□□□□ -2
SEC39Q12745 YPL150WYPL150W 2706 nt2.53□□□□□ -2
SEC39Q12745 YDR186CYDR186C 2634 nt2.52□□□□□ -2.01
SEC39Q12745 YNL122CYNL122C 348 nt2.52□□□□□ -2.01
SEC39Q12745 YOR055WYOR055W 435 nt2.52□□□□□ -2.01
SEC39Q12745 GAL7YBR018C 1101 nt2.52□□□□□ -2.01
SEC39Q12745 LEU3YLR451W 2661 nt2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.2 ms