Protein–RNA interactions for Protein: Q12472

TY2B-DR1, Transposon Ty2-DR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-DR1Q12472 snR11snR11 258 nt0.97□□□□□ -2.25
TY2B-DR1Q12472 YOR314WYOR314W 330 nt0.97□□□□□ -2.25
TY2B-DR1Q12472 YJR029WYJR029W 5268 nt0.97□□□□□ -2.25
TY2B-DR1Q12472 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt0.97□□□□□ -2.25
TY2B-DR1Q12472 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.97□□□□□ -2.25
TY2B-DR1Q12472 YGR290WYGR290W 444 nt0.96□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 HRT3YLR097C 1035 nt0.96□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 GPN3YLR243W 819 nt0.96□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 YOL114CYOL114C 609 nt0.96□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 TBS1YBR150C 3285 nt0.96□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 CTF18YMR078C 2226 nt0.96□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 MAL33YBR297W 1407 nt0.96□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 PCL9YDL179W 915 nt0.96□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 YER119C-AYER119C-A 372 nt0.96□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 YGR026WYGR026W 837 nt0.96□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 RIT1YMR283C 1542 nt0.95□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 PDS5YMR076C 3834 nt0.95□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 YCL068CYCL068C 783 nt0.94□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 YBR096WYBR096W 693 nt0.94□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 NPL6YMR091C 1308 nt0.94□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 YGR015CYGR015C 987 nt0.93□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 YUH1YJR099W 711 nt0.93□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 APD1YBR151W 951 nt0.93□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 SEC59YMR013C 1560 nt0.93□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 SRP1YNL189W 1629 nt0.93□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 TRM2YKR056W 1920 nt0.93□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 STE5YDR103W 2754 nt0.93□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 TAH1YCR060W 336 nt0.93□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 HTA1YDR225W 399 nt0.93□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 YHR145CYHR145C 357 nt0.93□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 NOP15YNL110C 663 nt0.93□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 NUP145YGL092W 3954 nt0.92□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 YCR007CYCR007C 720 nt0.92□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 EMC2YJR088C 879 nt0.92□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 UBX4YMR067C 1251 nt0.92□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 ERD2YBL040C 660 nt0.92□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 LDH1YBR204C 1128 nt0.92□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 GCD2YGR083C 1956 nt0.92□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 IFH1YLR223C 3258 nt0.91□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 CTK1YKL139W 1587 nt0.91□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 YDL062WYDL062W 426 nt0.91□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 RPA12YJR063W 378 nt0.91□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 MGE1YOR232W 687 nt0.91□□□□□ -2.26
TY2B-DR1Q12472 UBC13YDR092W 462 nt0.9□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.9□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 YJL169WYJL169W 369 nt0.9□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 STB4YMR019W 2850 nt0.89□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 NCL1YBL024W 2055 nt0.89□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 AIM36YMR157C 768 nt0.88□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 ZRG8YER033C 3231 nt0.88□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 YDL186WYDL186W 834 nt0.88□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 YEL075CYEL075C 369 nt0.88□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 FSH1YHR049W 732 nt0.88□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt0.88□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 CHC1YGL206C 4962 nt0.87□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 SWI6YLR182W 2412 nt0.87□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 PCL6YER059W 1263 nt0.87□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.87□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.87□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.87□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.87□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.87□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 GTR2YGR163W 1026 nt0.87□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 MSA2YKR077W 1092 nt0.87□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 RSA3YLR221C 663 nt0.87□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 MLH3YPL164C 2148 nt0.86□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 YGL242CYGL242C 546 nt0.85□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 YNL143CYNL143C 393 nt0.85□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 MED8YBR193C 672 nt0.85□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 RPL31AYDL075W 342 nt0.85□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 OMA1YKR087C 1038 nt0.85□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 FCF2YLR051C 654 nt0.85□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 SEC1YDR164C 2175 nt0.85□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 DXO1YDR370C 1329 nt0.84□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 UBP11YKR098C 2154 nt0.84□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 SUI2YJR007W 915 nt0.84□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 RNP1YLL046C 750 nt0.84□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 VTI1YMR197C 654 nt0.84□□□□□ -2.27
TY2B-DR1Q12472 RRT15YLR162W-A 189 nt0.83□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 MFB1YDR219C 1398 nt0.83□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 STE24YJR117W 1362 nt0.83□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 PUF4YGL014W 2667 nt0.83□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 AVT5YBL089W 1380 nt0.83□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 HAP4YKL109W 1665 nt0.83□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 CDC10YCR002C 969 nt0.82□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 TIM21YGR033C 720 nt0.82□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 VOA1YGR106C 798 nt0.82□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 SNX4YJL036W 1272 nt0.82□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 YLR053CYLR053C 327 nt0.82□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 YBL028CYBL028C 321 nt0.82□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 PRM4YPL156C 855 nt0.82□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 YTH1YPR107C 627 nt0.82□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 ESC2YDR363W 1371 nt0.81□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 CRD1YDL142C 852 nt0.81□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 RPS18BYML026C 441 nt0.81□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.81□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 snR76snR76 109 nt0.8□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 BNA7YDR428C 786 nt0.8□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 RSM26YJR101W 801 nt0.8□□□□□ -2.28
TY2B-DR1Q12472 UBC9YDL064W 474 nt0.8□□□□□ -2.28
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