Protein–RNA interactions for Protein: Q12463

TRM11, tRNA (guanine(10)-N2)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM11Q12463 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.36□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 NOP19YGR251W 591 nt3.36□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 RPS21BYJL136C 264 nt3.36□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 RPL23AYBL087C 414 nt3.36□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 BIL1YOR304C-A 231 nt3.36□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 SPC72YAL047C 1869 nt3.36□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 ENA2YDR039C 3276 nt3.36□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 ENA1YDR040C 3276 nt3.36□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 RGC1YPR115W 3252 nt3.36□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 SIN3YOL004W 4611 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 CHO2YGR157W 2610 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 SLM2YNL047C 1971 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 ATP17YDR377W 306 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 SPG3YDR504C 384 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 USE1YGL098W 738 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 JIP3YLR331C 378 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 PRE8YML092C 753 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 SLM6YBR266C 453 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 STE5YDR103W 2754 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 MUS81YDR386W 1899 nt3.35□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 YDL176WYDL176W 2127 nt3.34□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 KIN82YCR091W 2163 nt3.34□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 YKL100CYKL100C 1764 nt3.34□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 HMF1YER057C 390 nt3.34□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 RPC10YHR143W-A 213 nt3.34□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 YJL202CYJL202C 348 nt3.34□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 RPB11YOL005C 363 nt3.34□□□□□ -1.87
TRM11Q12463 HEF3YNL014W 3135 nt3.34□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 CSR2YPR030W 3366 nt3.34□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 MES1YGR264C 2256 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 JJJ2YJL162C 1752 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 ERG28YER044C 447 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 YER076W-AYER076W-A 348 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 YIR040CYIR040C 333 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 SRL3YKR091W 741 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 HHF1YBR009C 312 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 SLP1YOR154W 1764 nt3.33□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 RSE1YML049C 4086 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 XRN1YGL173C 4587 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 CIN8YEL061C 3003 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 RPL23BYER117W 414 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 RPL1BYGL135W 654 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 YJR023CYJR023C 402 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 SHE2YKL130C 741 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 YLR031WYLR031W 561 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 RPL37AYLR185W 267 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 PDS5YMR076C 3834 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 SSN8YNL025C 972 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 RPL1AYPL220W 654 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 DPB11YJL090C 2295 nt3.32□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 IRC4YDR540C 540 nt3.31□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 YER066C-AYER066C-A 501 nt3.31□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 RPL39YJL189W 156 nt3.31□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 JLP2YMR132C 627 nt3.31□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 FAS1YKL182W 6156 nt3.3□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 MSL1YIR009W 336 nt3.3□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 YNL337WYNL337W 255 nt3.3□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 YPL238CYPL238C 390 nt3.3□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 SNX41YDR425W 1878 nt3.3□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 NDT80YHR124W 1884 nt3.3□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 MDM32YOR147W 1869 nt3.3□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 NDD1YOR372C 1665 nt3.3□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 BCH1YMR237W 2175 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 TLC1TLC1 1301 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 ECM21YBL101C 3354 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 CAJ1YER048C 1176 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 YER188C-AYER188C-A 300 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 YKL111CYKL111C 336 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 HEM4YOR278W 828 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 EGD1YPL037C 474 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 BYE1YKL005C 1785 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 ZDS2YML109W 2829 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 FLO9YAL063C 3969 nt3.28□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 ROG1YGL144C 2058 nt3.28□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 YLR416CYLR416C 399 nt3.28□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 YPR053CYPR053C 456 nt3.28□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 ORC1YML065W 2745 nt3.28□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 YSW1YBR148W 1830 nt3.28□□□□□ -1.88
TRM11Q12463 ATP22YDR350C 2055 nt3.28□□□□□ -1.89
TRM11Q12463 SNF12YNR023W 1701 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM11Q12463 MDM1YML104C 3384 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM11Q12463 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM11Q12463 GPI14YJR013W 1212 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM11Q12463 PGA1YNL158W 597 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM11Q12463 PWP2YCR057C 2772 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM11Q12463 CIN1YOR349W 3045 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM11Q12463 NAB6YML117W 3405 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM11Q12463 RPB9YGL070C 369 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM11Q12463 BAT1YHR208W 1182 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM11Q12463 ISF1YMR081C 1017 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM11Q12463 ARG2YJL071W 1725 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM11Q12463 ARK1YNL020C 1917 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM11Q12463 RPN1YHR027C 2982 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM11Q12463 VHR2YER064C 1518 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM11Q12463 TIF35YDR429C 825 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM11Q12463 RMT2YDR465C 1239 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM11Q12463 YER107W-AYER107W-A 321 nt3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.5 ms