Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 CAT2YML042W 2013 nt1.67□□□□□ -2.14
USB1Q12208 YDL157CYDL157C 357 nt1.67□□□□□ -2.14
USB1Q12208 YER158W-AYER158W-A 216 nt1.67□□□□□ -2.14
USB1Q12208 FYV4YHR059W 393 nt1.67□□□□□ -2.14
USB1Q12208 YPT52YKR014C 705 nt1.67□□□□□ -2.14
USB1Q12208 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt1.67□□□□□ -2.14
USB1Q12208 NEO1YIL048W 3456 nt1.67□□□□□ -2.14
USB1Q12208 SET2YJL168C 2202 nt1.66□□□□□ -2.14
USB1Q12208 MIC19YFR011C 513 nt1.66□□□□□ -2.14
USB1Q12208 RPA34YJL148W 702 nt1.66□□□□□ -2.14
USB1Q12208 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.66□□□□□ -2.14
USB1Q12208 SMD2YLR275W 333 nt1.66□□□□□ -2.14
USB1Q12208 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt1.66□□□□□ -2.14
USB1Q12208 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.66□□□□□ -2.14
USB1Q12208 SFG1YOR315W 1041 nt1.66□□□□□ -2.14
USB1Q12208 YCL007CYCL007C 393 nt1.66□□□□□ -2.14
USB1Q12208 HSE1YHL002W 1359 nt1.66□□□□□ -2.14
USB1Q12208 LRE1YCL051W 1752 nt1.66□□□□□ -2.14
USB1Q12208 DNF3YMR162C 4971 nt1.66□□□□□ -2.14
USB1Q12208 LST4YKL176C 2487 nt1.65□□□□□ -2.14
USB1Q12208 YDR338CYDR338C 2088 nt1.65□□□□□ -2.14
USB1Q12208 BUD2YKL092C 3315 nt1.65□□□□□ -2.14
USB1Q12208 STI1YOR027W 1770 nt1.65□□□□□ -2.14
USB1Q12208 SEC31YDL195W 3822 nt1.65□□□□□ -2.15
USB1Q12208 SLU7YDR088C 1149 nt1.65□□□□□ -2.15
USB1Q12208 YDR199WYDR199W 366 nt1.65□□□□□ -2.15
USB1Q12208 DAD4YDR320C-A 219 nt1.65□□□□□ -2.15
USB1Q12208 IRC4YDR540C 540 nt1.65□□□□□ -2.15
USB1Q12208 YAL064WYAL064W 285 nt1.65□□□□□ -2.15
USB1Q12208 HRI1YLR301W 735 nt1.65□□□□□ -2.15
USB1Q12208 YNR021WYNR021W 1215 nt1.65□□□□□ -2.15
USB1Q12208 YBR062CYBR062C 543 nt1.65□□□□□ -2.15
USB1Q12208 CHC1YGL206C 4962 nt1.65□□□□□ -2.15
USB1Q12208 MET18YIL128W 3099 nt1.65□□□□□ -2.15
USB1Q12208 DFG16YOR030W 1860 nt1.65□□□□□ -2.15
USB1Q12208 KAP123YER110C 3342 nt1.64□□□□□ -2.15
USB1Q12208 YCR013CYCR013C 648 nt1.64□□□□□ -2.15
USB1Q12208 CAJ1YER048C 1176 nt1.64□□□□□ -2.15
USB1Q12208 FSH1YHR049W 732 nt1.64□□□□□ -2.15
USB1Q12208 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt1.64□□□□□ -2.15
USB1Q12208 SWM2YNR004W 441 nt1.64□□□□□ -2.15
USB1Q12208 ARL1YBR164C 552 nt1.64□□□□□ -2.15
USB1Q12208 DAL5YJR152W 1632 nt1.64□□□□□ -2.15
USB1Q12208 RNH70YGR276C 1662 nt1.64□□□□□ -2.15
USB1Q12208 MES1YGR264C 2256 nt1.64□□□□□ -2.15
USB1Q12208 HSH155YMR288W 2916 nt1.63□□□□□ -2.15
USB1Q12208 HCS1YKL017C 2052 nt1.63□□□□□ -2.15
USB1Q12208 SAG1YJR004C 1953 nt1.63□□□□□ -2.15
USB1Q12208 HSL1YKL101W 4557 nt1.63□□□□□ -2.15
USB1Q12208 AGC1YPR021C 2709 nt1.63□□□□□ -2.15
USB1Q12208 PEX8YGR077C 1770 nt1.63□□□□□ -2.15
USB1Q12208 ATP16YDL004W 483 nt1.63□□□□□ -2.15
USB1Q12208 YDL163WYDL163W 303 nt1.63□□□□□ -2.15
USB1Q12208 STE2YFL026W 1296 nt1.63□□□□□ -2.15
USB1Q12208 YLR255CYLR255C 354 nt1.63□□□□□ -2.15
USB1Q12208 DCP1YOL149W 696 nt1.63□□□□□ -2.15
USB1Q12208 TRM7YBR061C 933 nt1.63□□□□□ -2.15
USB1Q12208 STD1YOR047C 1335 nt1.63□□□□□ -2.15
USB1Q12208 PRK1YIL095W 2433 nt1.62□□□□□ -2.15
USB1Q12208 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.62□□□□□ -2.15
USB1Q12208 ATG38YLR211C 681 nt1.62□□□□□ -2.15
USB1Q12208 YOL106WYOL106W 354 nt1.62□□□□□ -2.15
USB1Q12208 VPS34YLR240W 2628 nt1.62□□□□□ -2.15
USB1Q12208 CFT2YLR115W 2580 nt1.61□□□□□ -2.15
USB1Q12208 PSO2YMR137C 1986 nt1.61□□□□□ -2.15
USB1Q12208 YJL016WYJL016W 1686 nt1.61□□□□□ -2.15
USB1Q12208 PRP38YGR075C 729 nt1.61□□□□□ -2.15
USB1Q12208 YAL066WYAL066W 309 nt1.61□□□□□ -2.15
USB1Q12208 RPS16AYMR143W 432 nt1.61□□□□□ -2.15
USB1Q12208 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt1.61□□□□□ -2.15
USB1Q12208 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.61□□□□□ -2.15
USB1Q12208 TUS1YLR425W 3924 nt1.6□□□□□ -2.15
USB1Q12208 PET309YLR067C 2898 nt1.6□□□□□ -2.15
USB1Q12208 FMP16YDR070C 282 nt1.6□□□□□ -2.15
USB1Q12208 YER068C-AYER068C-A 432 nt1.6□□□□□ -2.15
USB1Q12208 COX8YLR395C 237 nt1.6□□□□□ -2.15
USB1Q12208 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.6□□□□□ -2.15
USB1Q12208 YOR392WYOR392W 444 nt1.6□□□□□ -2.15
USB1Q12208 AME1YBR211C 975 nt1.6□□□□□ -2.15
USB1Q12208 YNL144CYNL144C 2223 nt1.6□□□□□ -2.15
USB1Q12208 REV1YOR346W 2958 nt1.6□□□□□ -2.15
USB1Q12208 MYO4YAL029C 4416 nt1.6□□□□□ -2.15
USB1Q12208 SOK2YMR016C 2358 nt1.59□□□□□ -2.15
USB1Q12208 NCB2YDR397C 441 nt1.59□□□□□ -2.15
USB1Q12208 NTF2YER009W 378 nt1.59□□□□□ -2.15
USB1Q12208 YFR056CYFR056C 369 nt1.59□□□□□ -2.15
USB1Q12208 YGL165CYGL165C 579 nt1.59□□□□□ -2.15
USB1Q12208 YGL230CYGL230C 444 nt1.59□□□□□ -2.15
USB1Q12208 THG1YGR024C 714 nt1.59□□□□□ -2.15
USB1Q12208 SUI2YJR007W 915 nt1.59□□□□□ -2.15
USB1Q12208 YLR366WYLR366W 306 nt1.59□□□□□ -2.15
USB1Q12208 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt1.59□□□□□ -2.15
USB1Q12208 MIX23YBL107C 591 nt1.59□□□□□ -2.15
USB1Q12208 SRL4YPL033C 846 nt1.59□□□□□ -2.15
USB1Q12208 RXT2YBR095C 1293 nt1.59□□□□□ -2.15
USB1Q12208 SNF12YNR023W 1701 nt1.59□□□□□ -2.16
USB1Q12208 VPS15YBR097W 4365 nt1.59□□□□□ -2.16
USB1Q12208 SSF2YDR312W 1362 nt1.59□□□□□ -2.16
USB1Q12208 DIS3YOL021C 3006 nt1.58□□□□□ -2.16
USB1Q12208 GUP1YGL084C 1683 nt1.58□□□□□ -2.16
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