Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCRN3Q0VDG4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCRN3Q0VDG4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms