Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms