Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ACTN3Q08043 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms