Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLEQ07864 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLEQ07864 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLEQ07864 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLEQ07864 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLEQ07864 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLEQ07864 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLEQ07864 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLEQ07864 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLEQ07864 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLEQ07864 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLEQ07864 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLEQ07864 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLEQ07864 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLEQ07864 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLEQ07864 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLEQ07864 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLEQ07864 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLEQ07864 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLEQ07864 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLEQ07864 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLEQ07864 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLEQ07864 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLEQ07864 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLEQ07864 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLEQ07864 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLEQ07864 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLEQ07864 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLEQ07864 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLEQ07864 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLEQ07864 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLEQ07864 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLEQ07864 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLEQ07864 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLEQ07864 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLEQ07864 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLEQ07864 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLEQ07864 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLEQ07864 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLEQ07864 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLEQ07864 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLEQ07864 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLEQ07864 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLEQ07864 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLEQ07864 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLEQ07864 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLEQ07864 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLEQ07864 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLEQ07864 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLEQ07864 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLEQ07864 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLEQ07864 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLEQ07864 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLEQ07864 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLEQ07864 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLEQ07864 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLEQ07864 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLEQ07864 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLEQ07864 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLEQ07864 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLEQ07864 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLEQ07864 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLEQ07864 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLEQ07864 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLEQ07864 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLEQ07864 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLEQ07864 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLEQ07864 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLEQ07864 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLEQ07864 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLEQ07864 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLEQ07864 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLEQ07864 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLEQ07864 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLEQ07864 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLEQ07864 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLEQ07864 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLEQ07864 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLEQ07864 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLEQ07864 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLEQ07864 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLEQ07864 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLEQ07864 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLEQ07864 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLEQ07864 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLEQ07864 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLEQ07864 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLEQ07864 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLEQ07864 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLEQ07864 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLEQ07864 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLEQ07864 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLEQ07864 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLEQ07864 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLEQ07864 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLEQ07864 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLEQ07864 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLEQ07864 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLEQ07864 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLEQ07864 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms