Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNDQ07001 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNDQ07001 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms