Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PAX8Q06710 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms