Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPB1Q06547 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABPB1Q06547 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms