Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CD164Q04900 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
CD164Q04900 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CD164Q04900 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CD164Q04900 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CD164Q04900 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CD164Q04900 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CD164Q04900 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CD164Q04900 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CD164Q04900 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CD164Q04900 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CD164Q04900 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CD164Q04900 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CD164Q04900 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CD164Q04900 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CD164Q04900 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CD164Q04900 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CD164Q04900 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CD164Q04900 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CD164Q04900 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CD164Q04900 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
CD164Q04900 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CD164Q04900 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
CD164Q04900 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CD164Q04900 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CD164Q04900 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD164Q04900 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD164Q04900 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD164Q04900 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD164Q04900 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD164Q04900 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CD164Q04900 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms