Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAV1Q03135 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms