Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP4Q02446 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP4Q02446 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP4Q02446 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP4Q02446 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP4Q02446 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP4Q02446 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP4Q02446 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP4Q02446 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP4Q02446 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP4Q02446 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP4Q02446 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP4Q02446 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP4Q02446 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP4Q02446 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP4Q02446 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SP4Q02446 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP4Q02446 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP4Q02446 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP4Q02446 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP4Q02446 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP4Q02446 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP4Q02446 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP4Q02446 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP4Q02446 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP4Q02446 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP4Q02446 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP4Q02446 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP4Q02446 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP4Q02446 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP4Q02446 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SP4Q02446 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP4Q02446 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP4Q02446 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP4Q02446 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP4Q02446 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP4Q02446 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP4Q02446 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP4Q02446 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP4Q02446 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP4Q02446 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP4Q02446 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP4Q02446 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP4Q02446 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP4Q02446 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP4Q02446 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP4Q02446 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP4Q02446 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP4Q02446 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SP4Q02446 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP4Q02446 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP4Q02446 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP4Q02446 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP4Q02446 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP4Q02446 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP4Q02446 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP4Q02446 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SP4Q02446 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP4Q02446 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP4Q02446 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SP4Q02446 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SP4Q02446 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP4Q02446 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP4Q02446 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP4Q02446 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP4Q02446 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP4Q02446 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP4Q02446 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP4Q02446 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP4Q02446 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP4Q02446 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP4Q02446 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP4Q02446 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP4Q02446 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP4Q02446 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP4Q02446 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP4Q02446 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP4Q02446 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP4Q02446 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP4Q02446 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP4Q02446 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP4Q02446 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP4Q02446 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP4Q02446 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP4Q02446 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP4Q02446 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SP4Q02446 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP4Q02446 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP4Q02446 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SP4Q02446 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP4Q02446 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP4Q02446 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP4Q02446 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP4Q02446 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP4Q02446 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP4Q02446 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP4Q02446 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP4Q02446 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP4Q02446 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP4Q02446 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms