Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APBA1Q02410 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms