Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFRSF17Q02223 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms