Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLCB3Q01970 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms