Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPIBQ01892 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPIBQ01892 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms