Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
XPCQ01831 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPCQ01831 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPCQ01831 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPCQ01831 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPCQ01831 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPCQ01831 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPCQ01831 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPCQ01831 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XPCQ01831 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
XPCQ01831 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
XPCQ01831 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
XPCQ01831 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XPCQ01831 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XPCQ01831 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
XPCQ01831 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XPCQ01831 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XPCQ01831 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
XPCQ01831 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
XPCQ01831 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
XPCQ01831 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
XPCQ01831 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
XPCQ01831 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
XPCQ01831 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
XPCQ01831 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
XPCQ01831 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
XPCQ01831 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
XPCQ01831 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
XPCQ01831 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
XPCQ01831 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
XPCQ01831 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
XPCQ01831 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
XPCQ01831 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
XPCQ01831 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
XPCQ01831 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
XPCQ01831 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
XPCQ01831 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
XPCQ01831 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
XPCQ01831 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
XPCQ01831 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
XPCQ01831 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
XPCQ01831 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
XPCQ01831 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
XPCQ01831 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
XPCQ01831 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
XPCQ01831 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
XPCQ01831 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
XPCQ01831 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
XPCQ01831 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
XPCQ01831 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
XPCQ01831 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
XPCQ01831 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
XPCQ01831 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
XPCQ01831 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
XPCQ01831 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
XPCQ01831 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
XPCQ01831 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
XPCQ01831 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
XPCQ01831 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
XPCQ01831 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
XPCQ01831 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
XPCQ01831 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPCQ01831 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPCQ01831 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPCQ01831 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPCQ01831 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPCQ01831 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPCQ01831 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPCQ01831 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPCQ01831 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPCQ01831 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPCQ01831 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPCQ01831 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPCQ01831 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPCQ01831 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPCQ01831 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPCQ01831 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
XPCQ01831 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
XPCQ01831 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
XPCQ01831 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
XPCQ01831 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
XPCQ01831 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
XPCQ01831 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
XPCQ01831 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
XPCQ01831 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
XPCQ01831 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XPCQ01831 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
XPCQ01831 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
XPCQ01831 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
XPCQ01831 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
XPCQ01831 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
XPCQ01831 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
XPCQ01831 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XPCQ01831 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
XPCQ01831 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
XPCQ01831 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XPCQ01831 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
XPCQ01831 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
XPCQ01831 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
XPCQ01831 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms