Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC42EP1Q00587 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms