Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVPABLB-1P60509 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms