Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDL3P58872 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms