Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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RAD23BP54727 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAD23BP54727 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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RAD23BP54727 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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RAD23BP54727 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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RAD23BP54727 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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RAD23BP54727 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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RAD23BP54727 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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RAD23BP54727 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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RAD23BP54727 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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RAD23BP54727 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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RAD23BP54727 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAD23BP54727 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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