Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CACNA2D1P54289 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D1P54289 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms