Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP98P52948 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP98P52948 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP98P52948 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP98P52948 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP98P52948 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP98P52948 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP98P52948 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP98P52948 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP98P52948 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP98P52948 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP98P52948 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP98P52948 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP98P52948 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP98P52948 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP98P52948 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP98P52948 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP98P52948 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP98P52948 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP98P52948 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP98P52948 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP98P52948 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP98P52948 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP98P52948 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP98P52948 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP98P52948 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP98P52948 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP98P52948 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP98P52948 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP98P52948 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP98P52948 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP98P52948 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP98P52948 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP98P52948 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP98P52948 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP98P52948 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP98P52948 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP98P52948 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP98P52948 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP98P52948 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP98P52948 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP98P52948 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP98P52948 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP98P52948 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP98P52948 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP98P52948 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP98P52948 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP98P52948 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP98P52948 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP98P52948 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP98P52948 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP98P52948 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP98P52948 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP98P52948 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP98P52948 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP98P52948 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP98P52948 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP98P52948 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP98P52948 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP98P52948 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP98P52948 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP98P52948 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP98P52948 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP98P52948 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP98P52948 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP98P52948 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP98P52948 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP98P52948 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP98P52948 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP98P52948 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP98P52948 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP98P52948 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP98P52948 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP98P52948 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP98P52948 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP98P52948 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms